Клинико-диагностическая лаборатория (КДЛ) существует с момента образования онкодиспансера и ранее входила в состав поликлинического отделения. С 2002 КДЛ года является самостоятельным структурным подразделением, расположена на втором этаже здания. Лаборатория оснащена современной оптической техникой, биохимическим анализатором фирмы «Hitachi». Выполняет все основные гематологические, биохимические анализы; исследует кровь на онкомаркеры; в 2002 году освоены иммуногистохимические исследования (Her 2-neo).